Les groupes de recherche rassemblent des chercheurs sur base de projets à court terme, se concrétisant en des colloques ou d’autres activités, débouchant sur des publications partielles.
- Groupe de recherche Cinespi
- Groupe de recherche en études bouddhiques et hindouistes (GREBH)
- Groupe de recherche en théologies et sciences des religions
- Groupe de recherche "Septante et critique textuelle" (SSTC)
- Groupe de recherche sur le Cantique des cantiques
- Groupe de recherche en éthique comparée
- Groupe de recherche Démocraties internes (GRDI) (ISPOLE-RSCS-ISP)
- Groupe de recherche sur «Figures et formes de la spiritualité dans la littérature et les expressions artistiques» (INCAL)
- Groupe de contact du FNRS "Penser le religieux en Europe" (ISP)