Les présidents de l’Institut unitaire
| Désiré Mercier (1889-1906) |
| Simon Deploige (1906-1927) |
| Léon Noël (1928-1948) |
| Louis De Raeymaeker (1948-1966) |
| Albert Dondeyne (1966-1968) |
Les présidents de l’Institut après la séparation
| Georges Van Riet (1969-1977) |
| Jean Ladrière (1977-1983) |
Les doyens (portant également le titre de président)
| Jean Ladrière (1983-1986) |
| André Berten (1986-1990) |
| Claude Troisfontaines (1990-1995) |
| Thierry Lucas (1995-2000) |
| Gilbert Gérard (2000-2003) |
| Michel Dupuis (2003-2008) |
| Bernard Feltz (2008-2009) |
Les présidents après la réforme de 2009
| Bernard Feltz (2009-2011) |
| Danielle Lories (2011-2014) |
| Jean-Michel Counet (2014-2017) |